La phytoépuration est un système d’assainissement des eaux usées par les plantes.
Elle utilise les bactéries naturellement présentes dans le système racinaire des plantes pour épurer l’eau. Les bactéries aérobies (c’est-à-dire qui ont besoin d’oxygène et qui ne dégagent pas de mauvaises odeurs) décomposent les matières organiques polluantes. Elles les transforment alors en matière minérale assimilable par les plantes. En retour, les plantes aquatiques fournissent de l’oxygène aux bactéries par leurs racines.
La phytoépuration repose sur l'installation de filtres végétalisés:
Dans les deux cas, les filtres peuvent être étanches ou non. Un système non étanche permettrait aux eaux traitées de s’infiltrer dans le sol (par le fond du filtre), qui participe ainsi à l’épuration. Selon les contraintes du site (perméabilité du sol, présence ou non d’une nappe phréatique, etc) et la réglementation locale, on s’orientera vers un système étanche ou non.